Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd1Q01822 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms