Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Top2aQ01320 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Top2aQ01320 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms