Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Grin2bQ01097 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Grin2bQ01097 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms