Protein–RNA interactions for Protein: P97953

Vegfc, Vascular endothelial growth factor C, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfcP97953 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VegfcP97953 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VegfcP97953 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VegfcP97953 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VegfcP97953 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VegfcP97953 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VegfcP97953 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VegfcP97953 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VegfcP97953 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfcP97953 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfcP97953 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfcP97953 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfcP97953 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfcP97953 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfcP97953 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfcP97953 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfcP97953 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfcP97953 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfcP97953 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfcP97953 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfcP97953 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfcP97953 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfcP97953 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfcP97953 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfcP97953 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfcP97953 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfcP97953 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfcP97953 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfcP97953 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfcP97953 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfcP97953 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfcP97953 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfcP97953 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfcP97953 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfcP97953 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfcP97953 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VegfcP97953 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfcP97953 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfcP97953 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfcP97953 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VegfcP97953 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms