Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad1P70340 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad1P70340 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad1P70340 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad1P70340 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad1P70340 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad1P70340 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad1P70340 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad1P70340 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad1P70340 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad1P70340 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad1P70340 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad1P70340 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smad1P70340 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms