Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp7P70280 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms