Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb4bP68372 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms