Protein–RNA interactions for Protein: P63006

Lhx1, LIM/homeobox protein Lhx1, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx1P63006 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lhx1P63006 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lhx1P63006 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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