Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhbdl3P58873 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms