Protein–RNA interactions for Protein: P58854

Tubgcp3, Gamma-tubulin complex component 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp3P58854 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubgcp3P58854 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubgcp3P58854 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms