Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ctdsp1P58466 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms