Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bace1P56818 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bace1P56818 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bace1P56818 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bace1P56818 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bace1P56818 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Bace1P56818 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bace1P56818 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Bace1P56818 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms