Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacnb3P54285 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms