Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RabggtbP53612 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms