Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apobec1P51908 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Apobec1P51908 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Apobec1P51908 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apobec1P51908 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apobec1P51908 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Apobec1P51908 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Apobec1P51908 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apobec1P51908 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apobec1P51908 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apobec1P51908 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Apobec1P51908 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Apobec1P51908 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Apobec1P51908 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apobec1P51908 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apobec1P51908 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apobec1P51908 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apobec1P51908 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Apobec1P51908 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Apobec1P51908 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec1P51908 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec1P51908 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec1P51908 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec1P51908 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec1P51908 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec1P51908 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec1P51908 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec1P51908 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec1P51908 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec1P51908 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec1P51908 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec1P51908 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec1P51908 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec1P51908 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec1P51908 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Apobec1P51908 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec1P51908 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Apobec1P51908 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec1P51908 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Apobec1P51908 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Apobec1P51908 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec1P51908 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec1P51908 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec1P51908 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec1P51908 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec1P51908 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec1P51908 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec1P51908 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec1P51908 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec1P51908 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec1P51908 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec1P51908 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec1P51908 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec1P51908 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec1P51908 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec1P51908 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec1P51908 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec1P51908 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec1P51908 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec1P51908 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec1P51908 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec1P51908 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec1P51908 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec1P51908 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec1P51908 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec1P51908 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec1P51908 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec1P51908 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec1P51908 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec1P51908 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Apobec1P51908 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec1P51908 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec1P51908 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec1P51908 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec1P51908 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec1P51908 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Apobec1P51908 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apobec1P51908 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Apobec1P51908 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apobec1P51908 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Apobec1P51908 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Apobec1P51908 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apobec1P51908 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apobec1P51908 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Apobec1P51908 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apobec1P51908 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apobec1P51908 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Apobec1P51908 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apobec1P51908 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apobec1P51908 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apobec1P51908 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apobec1P51908 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apobec1P51908 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apobec1P51908 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Apobec1P51908 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Apobec1P51908 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apobec1P51908 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apobec1P51908 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms