Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HpdP49429 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HpdP49429 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HpdP49429 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HpdP49429 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HpdP49429 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HpdP49429 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HpdP49429 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HpdP49429 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HpdP49429 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HpdP49429 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HpdP49429 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HpdP49429 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HpdP49429 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HpdP49429 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HpdP49429 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HpdP49429 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HpdP49429 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HpdP49429 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HpdP49429 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HpdP49429 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HpdP49429 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HpdP49429 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HpdP49429 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HpdP49429 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HpdP49429 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HpdP49429 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HpdP49429 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HpdP49429 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HpdP49429 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HpdP49429 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HpdP49429 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HpdP49429 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HpdP49429 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HpdP49429 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HpdP49429 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HpdP49429 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HpdP49429 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HpdP49429 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HpdP49429 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HpdP49429 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HpdP49429 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HpdP49429 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HpdP49429 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HpdP49429 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HpdP49429 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HpdP49429 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HpdP49429 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HpdP49429 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HpdP49429 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HpdP49429 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HpdP49429 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HpdP49429 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HpdP49429 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HpdP49429 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HpdP49429 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HpdP49429 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HpdP49429 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HpdP49429 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HpdP49429 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HpdP49429 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HpdP49429 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HpdP49429 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HpdP49429 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HpdP49429 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HpdP49429 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HpdP49429 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HpdP49429 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HpdP49429 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HpdP49429 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HpdP49429 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HpdP49429 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HpdP49429 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HpdP49429 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HpdP49429 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HpdP49429 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HpdP49429 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HpdP49429 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HpdP49429 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HpdP49429 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HpdP49429 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HpdP49429 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HpdP49429 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HpdP49429 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HpdP49429 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HpdP49429 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HpdP49429 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HpdP49429 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HpdP49429 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HpdP49429 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HpdP49429 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HpdP49429 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HpdP49429 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HpdP49429 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HpdP49429 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HpdP49429 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HpdP49429 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HpdP49429 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HpdP49429 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HpdP49429 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms