Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rbp3P49194 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbp3P49194 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms