Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox8bP48772 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox8bP48772 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox8bP48772 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox8bP48772 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox8bP48772 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox8bP48772 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox8bP48772 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox8bP48772 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox8bP48772 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox8bP48772 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox8bP48772 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox8bP48772 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox8bP48772 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox8bP48772 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox8bP48772 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox8bP48772 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox8bP48772 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox8bP48772 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox8bP48772 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox8bP48772 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox8bP48772 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cox8bP48772 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cox8bP48772 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms