Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf1P46099 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf1P46099 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf1P46099 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf1P46099 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf1P46099 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf1P46099 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf1P46099 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf1P46099 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klf1P46099 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms