Protein–RNA interactions for Protein: P42703

Lifr, Leukemia inhibitory factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LifrP42703 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LifrP42703 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LifrP42703 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LifrP42703 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LifrP42703 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LifrP42703 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LifrP42703 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LifrP42703 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LifrP42703 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LifrP42703 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LifrP42703 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LifrP42703 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LifrP42703 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LifrP42703 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LifrP42703 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LifrP42703 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LifrP42703 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LifrP42703 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LifrP42703 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LifrP42703 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LifrP42703 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LifrP42703 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LifrP42703 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LifrP42703 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LifrP42703 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LifrP42703 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LifrP42703 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LifrP42703 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LifrP42703 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LifrP42703 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LifrP42703 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LifrP42703 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LifrP42703 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LifrP42703 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LifrP42703 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LifrP42703 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LifrP42703 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LifrP42703 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LifrP42703 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LifrP42703 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LifrP42703 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LifrP42703 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LifrP42703 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LifrP42703 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LifrP42703 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LifrP42703 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LifrP42703 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LifrP42703 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LifrP42703 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LifrP42703 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LifrP42703 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LifrP42703 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LifrP42703 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LifrP42703 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LifrP42703 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LifrP42703 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LifrP42703 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LifrP42703 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LifrP42703 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LifrP42703 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LifrP42703 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LifrP42703 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LifrP42703 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LifrP42703 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LifrP42703 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LifrP42703 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LifrP42703 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LifrP42703 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LifrP42703 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LifrP42703 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LifrP42703 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LifrP42703 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LifrP42703 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LifrP42703 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LifrP42703 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LifrP42703 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LifrP42703 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LifrP42703 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LifrP42703 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LifrP42703 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LifrP42703 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LifrP42703 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LifrP42703 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LifrP42703 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LifrP42703 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LifrP42703 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LifrP42703 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LifrP42703 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LifrP42703 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LifrP42703 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LifrP42703 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LifrP42703 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LifrP42703 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LifrP42703 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LifrP42703 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LifrP42703 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LifrP42703 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LifrP42703 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LifrP42703 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LifrP42703 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms