Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd28P31041 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cd28P31041 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd28P31041 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cd28P31041 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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