Protein–RNA interactions for Protein: P28661

Sept4, Septin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept4P28661 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sept4P28661 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept4P28661 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept4P28661 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept4P28661 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept4P28661 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept4P28661 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept4P28661 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept4P28661 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept4P28661 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms