Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

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Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BgnP28653 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BgnP28653 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BgnP28653 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BgnP28653 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BgnP28653 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BgnP28653 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BgnP28653 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BgnP28653 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BgnP28653 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BgnP28653 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BgnP28653 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BgnP28653 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BgnP28653 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BgnP28653 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BgnP28653 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BgnP28653 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BgnP28653 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
BgnP28653 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BgnP28653 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BgnP28653 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BgnP28653 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BgnP28653 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BgnP28653 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BgnP28653 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BgnP28653 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BgnP28653 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
BgnP28653 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BgnP28653 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BgnP28653 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BgnP28653 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BgnP28653 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BgnP28653 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BgnP28653 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BgnP28653 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BgnP28653 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
BgnP28653 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
BgnP28653 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BgnP28653 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BgnP28653 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BgnP28653 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BgnP28653 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BgnP28653 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BgnP28653 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BgnP28653 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BgnP28653 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BgnP28653 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BgnP28653 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BgnP28653 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BgnP28653 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BgnP28653 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BgnP28653 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
BgnP28653 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
BgnP28653 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BgnP28653 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BgnP28653 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
BgnP28653 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BgnP28653 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BgnP28653 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BgnP28653 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BgnP28653 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BgnP28653 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BgnP28653 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BgnP28653 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BgnP28653 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BgnP28653 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BgnP28653 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BgnP28653 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BgnP28653 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
BgnP28653 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
BgnP28653 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
BgnP28653 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BgnP28653 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BgnP28653 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BgnP28653 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
BgnP28653 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BgnP28653 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BgnP28653 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BgnP28653 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BgnP28653 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BgnP28653 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
BgnP28653 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BgnP28653 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
BgnP28653 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BgnP28653 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BgnP28653 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BgnP28653 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BgnP28653 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BgnP28653 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BgnP28653 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BgnP28653 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BgnP28653 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BgnP28653 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BgnP28653 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BgnP28653 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BgnP28653 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BgnP28653 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BgnP28653 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
BgnP28653 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
BgnP28653 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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