Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defa5P28312 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa5P28312 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa5P28312 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa5P28312 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa5P28312 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa5P28312 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Defa5P28312 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms