Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afxP27661 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afxP27661 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2afxP27661 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afxP27661 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afxP27661 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afxP27661 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afxP27661 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afxP27661 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afxP27661 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2afxP27661 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms