Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CftrP26361 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CftrP26361 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CftrP26361 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CftrP26361 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CftrP26361 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CftrP26361 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CftrP26361 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CftrP26361 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CftrP26361 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CftrP26361 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CftrP26361 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CftrP26361 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CftrP26361 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CftrP26361 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CftrP26361 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CftrP26361 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CftrP26361 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CftrP26361 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CftrP26361 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CftrP26361 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CftrP26361 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CftrP26361 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CftrP26361 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CftrP26361 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CftrP26361 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CftrP26361 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CftrP26361 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CftrP26361 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CftrP26361 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CftrP26361 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CftrP26361 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CftrP26361 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CftrP26361 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CftrP26361 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CftrP26361 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CftrP26361 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CftrP26361 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CftrP26361 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CftrP26361 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CftrP26361 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CftrP26361 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CftrP26361 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CftrP26361 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CftrP26361 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CftrP26361 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CftrP26361 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CftrP26361 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CftrP26361 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CftrP26361 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CftrP26361 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CftrP26361 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CftrP26361 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CftrP26361 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CftrP26361 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CftrP26361 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CftrP26361 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CftrP26361 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CftrP26361 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CftrP26361 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CftrP26361 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CftrP26361 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CftrP26361 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CftrP26361 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CftrP26361 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CftrP26361 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CftrP26361 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CftrP26361 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CftrP26361 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CftrP26361 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CftrP26361 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CftrP26361 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CftrP26361 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CftrP26361 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CftrP26361 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CftrP26361 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CftrP26361 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CftrP26361 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CftrP26361 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CftrP26361 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CftrP26361 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CftrP26361 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CftrP26361 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CftrP26361 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CftrP26361 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CftrP26361 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CftrP26361 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CftrP26361 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CftrP26361 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CftrP26361 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CftrP26361 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CftrP26361 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CftrP26361 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CftrP26361 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CftrP26361 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CftrP26361 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CftrP26361 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CftrP26361 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CftrP26361 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CftrP26361 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms