Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd12P23812 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms