Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tsta3P23591 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms