Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tpm3P21107 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3P21107 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms