Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a2P20490 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms