Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rag1P15919 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rag1P15919 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rag1P15919 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rag1P15919 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rag1P15919 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rag1P15919 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rag1P15919 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rag1P15919 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rag1P15919 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms