Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RhoP15409 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhoP15409 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RhoP15409 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhoP15409 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhoP15409 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhoP15409 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhoP15409 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhoP15409 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhoP15409 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhoP15409 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhoP15409 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhoP15409 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RhoP15409 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhoP15409 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhoP15409 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhoP15409 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhoP15409 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhoP15409 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhoP15409 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhoP15409 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhoP15409 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhoP15409 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhoP15409 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhoP15409 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhoP15409 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhoP15409 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhoP15409 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhoP15409 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RhoP15409 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhoP15409 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhoP15409 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RhoP15409 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RhoP15409 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RhoP15409 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhoP15409 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhoP15409 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhoP15409 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhoP15409 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhoP15409 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhoP15409 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhoP15409 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhoP15409 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhoP15409 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhoP15409 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RhoP15409 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RhoP15409 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RhoP15409 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RhoP15409 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RhoP15409 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RhoP15409 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RhoP15409 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RhoP15409 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RhoP15409 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RhoP15409 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RhoP15409 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RhoP15409 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RhoP15409 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RhoP15409 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RhoP15409 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RhoP15409 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RhoP15409 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RhoP15409 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RhoP15409 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RhoP15409 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RhoP15409 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RhoP15409 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RhoP15409 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RhoP15409 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RhoP15409 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RhoP15409 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RhoP15409 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RhoP15409 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RhoP15409 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RhoP15409 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RhoP15409 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RhoP15409 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhoP15409 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhoP15409 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RhoP15409 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhoP15409 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhoP15409 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhoP15409 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhoP15409 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhoP15409 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhoP15409 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhoP15409 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RhoP15409 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhoP15409 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhoP15409 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhoP15409 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhoP15409 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhoP15409 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhoP15409 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhoP15409 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhoP15409 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhoP15409 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhoP15409 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhoP15409 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RhoP15409 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms