Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrphP15331 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PrphP15331 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrphP15331 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PrphP15331 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrphP15331 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrphP15331 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrphP15331 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrphP15331 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrphP15331 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrphP15331 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrphP15331 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrphP15331 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrphP15331 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrphP15331 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrphP15331 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrphP15331 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrphP15331 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrphP15331 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrphP15331 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrphP15331 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PrphP15331 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrphP15331 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PrphP15331 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrphP15331 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrphP15331 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrphP15331 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrphP15331 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrphP15331 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrphP15331 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrphP15331 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrphP15331 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PrphP15331 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrphP15331 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrphP15331 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrphP15331 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrphP15331 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrphP15331 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrphP15331 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrphP15331 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrphP15331 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrphP15331 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrphP15331 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrphP15331 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrphP15331 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrphP15331 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrphP15331 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PrphP15331 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrphP15331 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrphP15331 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrphP15331 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrphP15331 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PrphP15331 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrphP15331 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrphP15331 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrphP15331 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrphP15331 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrphP15331 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrphP15331 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrphP15331 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrphP15331 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrphP15331 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrphP15331 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrphP15331 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrphP15331 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrphP15331 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PrphP15331 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PrphP15331 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrphP15331 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrphP15331 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrphP15331 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrphP15331 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrphP15331 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PrphP15331 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrphP15331 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrphP15331 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrphP15331 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrphP15331 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrphP15331 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrphP15331 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrphP15331 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrphP15331 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrphP15331 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrphP15331 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrphP15331 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrphP15331 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrphP15331 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrphP15331 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrphP15331 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrphP15331 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrphP15331 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrphP15331 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrphP15331 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrphP15331 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrphP15331 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrphP15331 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PrphP15331 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrphP15331 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrphP15331 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrphP15331 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms