Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Vpreb2P13373 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms