Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtcP11725 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtcP11725 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtcP11725 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
OtcP11725 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtcP11725 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtcP11725 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtcP11725 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtcP11725 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtcP11725 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtcP11725 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtcP11725 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtcP11725 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtcP11725 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtcP11725 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
OtcP11725 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtcP11725 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtcP11725 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtcP11725 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtcP11725 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtcP11725 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtcP11725 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtcP11725 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtcP11725 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtcP11725 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtcP11725 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtcP11725 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtcP11725 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtcP11725 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtcP11725 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtcP11725 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtcP11725 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtcP11725 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtcP11725 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtcP11725 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
OtcP11725 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtcP11725 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtcP11725 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtcP11725 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtcP11725 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtcP11725 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtcP11725 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtcP11725 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
OtcP11725 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtcP11725 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtcP11725 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
OtcP11725 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
OtcP11725 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtcP11725 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtcP11725 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
OtcP11725 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
OtcP11725 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtcP11725 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
OtcP11725 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
OtcP11725 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtcP11725 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtcP11725 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtcP11725 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtcP11725 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtcP11725 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtcP11725 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtcP11725 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtcP11725 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtcP11725 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtcP11725 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtcP11725 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtcP11725 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtcP11725 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtcP11725 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtcP11725 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtcP11725 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtcP11725 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtcP11725 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtcP11725 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtcP11725 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtcP11725 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtcP11725 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtcP11725 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtcP11725 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtcP11725 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtcP11725 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtcP11725 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtcP11725 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtcP11725 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtcP11725 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtcP11725 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtcP11725 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtcP11725 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtcP11725 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtcP11725 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtcP11725 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
OtcP11725 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtcP11725 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtcP11725 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtcP11725 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtcP11725 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtcP11725 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtcP11725 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
OtcP11725 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
OtcP11725 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms