Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd4P10628 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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