Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
P10404 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
P10404 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
P10404 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
P10404 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
P10404 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
P10404 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
P10404 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
P10404 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
P10404 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
P10404 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
P10404 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
P10404 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
P10404 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
P10404 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
P10404 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
P10404 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
P10404 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
P10404 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
P10404 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
P10404 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
P10404 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
P10404 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
P10404 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
P10404 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
P10404 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
P10404 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
P10404 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
P10404 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
P10404 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
P10404 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
P10404 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
P10404 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
P10404 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
P10404 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
P10404 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
P10404 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
P10404 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
P10404 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
P10404 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
P10404 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
P10404 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
P10404 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
P10404 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
P10404 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
P10404 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
P10404 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
P10404 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
P10404 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
P10404 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
P10404 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
P10404 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
P10404 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
P10404 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
P10404 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
P10404 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
P10404 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
P10404 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
P10404 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
P10404 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
P10404 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
P10404 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
P10404 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
P10404 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
P10404 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
P10404 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
P10404 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
P10404 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
P10404 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
P10404 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
P10404 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
P10404 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
P10404 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
P10404 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
P10404 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
P10404 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
P10404 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
P10404 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
P10404 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
P10404 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
P10404 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
P10404 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
P10404 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
P10404 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
P10404 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
P10404 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
P10404 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
P10404 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
P10404 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
P10404 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
P10404 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
P10404 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
P10404 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
P10404 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
P10404 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
P10404 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
P10404 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
P10404 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
P10404 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
P10404 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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