Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

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Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PdgfrbP05622 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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