Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
H2-Ab1P01921 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms