Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01641 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01641 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01641 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01641 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01641 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01641 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01641 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01641 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01641 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
P01641 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
P01641 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
P01641 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01641 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01641 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
P01641 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01641 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01641 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01641 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01641 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01641 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01641 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01641 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01641 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01641 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01641 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01641 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01641 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01641 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01641 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01641 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01641 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01641 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01641 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01641 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01641 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01641 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01641 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01641 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01641 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01641 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01641 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01641 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01641 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01641 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01641 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01641 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01641 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01641 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01641 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01641 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01641 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01641 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P01641 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01641 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01641 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01641 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01641 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01641 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01641 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01641 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01641 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01641 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01641 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01641 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01641 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01641 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01641 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01641 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01641 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P01641 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01641 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01641 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01641 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01641 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01641 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01641 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01641 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01641 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P01641 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01641 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01641 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01641 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01641 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01641 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01641 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01641 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01641 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01641 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01641 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01641 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01641 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01641 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01641 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01641 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01641 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01641 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01641 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01641 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01641 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms