Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hcn2O88703 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hcn2O88703 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hcn2O88703 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hcn2O88703 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hcn2O88703 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hcn2O88703 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hcn2O88703 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hcn2O88703 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hcn2O88703 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hcn2O88703 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hcn2O88703 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hcn2O88703 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hcn2O88703 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hcn2O88703 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hcn2O88703 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hcn2O88703 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Hcn2O88703 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hcn2O88703 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hcn2O88703 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hcn2O88703 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hcn2O88703 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hcn2O88703 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hcn2O88703 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hcn2O88703 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hcn2O88703 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hcn2O88703 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hcn2O88703 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hcn2O88703 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hcn2O88703 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hcn2O88703 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hcn2O88703 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hcn2O88703 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hcn2O88703 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hcn2O88703 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hcn2O88703 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hcn2O88703 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hcn2O88703 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hcn2O88703 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hcn2O88703 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hcn2O88703 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hcn2O88703 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hcn2O88703 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hcn2O88703 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hcn2O88703 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hcn2O88703 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hcn2O88703 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hcn2O88703 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hcn2O88703 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hcn2O88703 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hcn2O88703 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hcn2O88703 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hcn2O88703 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hcn2O88703 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hcn2O88703 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hcn2O88703 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hcn2O88703 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hcn2O88703 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hcn2O88703 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hcn2O88703 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hcn2O88703 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hcn2O88703 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hcn2O88703 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hcn2O88703 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hcn2O88703 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hcn2O88703 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hcn2O88703 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hcn2O88703 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hcn2O88703 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hcn2O88703 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hcn2O88703 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Hcn2O88703 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hcn2O88703 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hcn2O88703 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hcn2O88703 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hcn2O88703 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hcn2O88703 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hcn2O88703 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hcn2O88703 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hcn2O88703 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hcn2O88703 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hcn2O88703 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hcn2O88703 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hcn2O88703 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hcn2O88703 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hcn2O88703 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hcn2O88703 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hcn2O88703 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hcn2O88703 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hcn2O88703 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hcn2O88703 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hcn2O88703 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hcn2O88703 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hcn2O88703 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hcn2O88703 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hcn2O88703 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hcn2O88703 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hcn2O88703 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hcn2O88703 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hcn2O88703 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms