Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Gpr33-201ENSMUST00000040161 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Gm13806-201ENSMUST00000117822 325 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Olfr1468-ps1-201ENSMUST00000207287 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Vmn1r-ps77-201ENSMUST00000174184 921 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Vmn1r-ps75-201ENSMUST00000174316 920 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Gm16456-201ENSMUST00000174431 920 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 AC126673.2-201ENSMUST00000221052 686 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Olfr1260-201ENSMUST00000061830 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Olfr1453-201ENSMUST00000087773 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx8O35652 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms