Protein–RNA interactions for Protein: O35595

Ptch2, Protein patched homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptch2O35595 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptch2O35595 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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