Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Clk2O35491 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Clk2O35491 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk2O35491 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Clk2O35491 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk2O35491 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk2O35491 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Clk2O35491 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Clk2O35491 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Clk2O35491 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk2O35491 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms