Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TnxbO35452 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TnxbO35452 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TnxbO35452 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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TnxbO35452 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TnxbO35452 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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TnxbO35452 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TnxbO35452 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TnxbO35452 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TnxbO35452 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms