Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad6O35182 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad6O35182 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad6O35182 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad6O35182 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad6O35182 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad6O35182 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms