Protein–RNA interactions for Protein: J3QNV7

Gm10428, Predicted gene 10428, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10428J3QNV7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm10428J3QNV7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm10428J3QNV7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm10428J3QNV7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm10428J3QNV7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm10428J3QNV7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm10428J3QNV7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gm10428J3QNV7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gm10428J3QNV7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gm10428J3QNV7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm10428J3QNV7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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