Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930544D05RikJ3QK56 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms