Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sclt1G5E861 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sclt1G5E861 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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