Protein–RNA interactions for Protein: F8WIA3

Gm20604, Predicted gene 20604, mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20604F8WIA3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm20604F8WIA3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm20604F8WIA3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm20604F8WIA3 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Gm43589-201ENSMUST00000199400 1523 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Gm20604F8WIA3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms